实验室发酵罐使用前后都应认真清洗，特别是前后两次培养采用不同的菌株时，更应注意清洗和杀菌工作。实验室发酵罐内可进行清洗的任何部分都应认真清洗，否则都可能成为杂菌的滋生地。易被忽略而不能充分清洗的地方有喷嘴角内部与取样管内以及罐顶等处。
实验室发酵罐常用于科研院所、大专院校以及企业的微生物实验室，适用于微生物发酵培养基配方的筛选，发酵工艺参数的优化、生产工艺与菌种的验证，是精密发酵理想的试验设备。
1、校正pH电极和溶氧电极。
2、罐体灭菌。根据需要将培养基配入罐体，按要求封好后，小型发酵罐(5L)可将罐体放入大灭菌锅灭菌(115℃，30分钟);大型发酵罐(10L及以上)采用蒸汽灭菌(121℃，30min)。
3、待罐体冷却后，将其置于发酵台上，安装完好;打开冷却水，打开气泵电源，连接通气管道开始通气，调节进气旋钮使通气量适当,使罐压保持在0.05MPa;设置温度、pH、搅拌速度等，并在确定的转速和通气量下对溶氧电极进行斜率标定，数值为100%
4、待温度稳定，各项参数都正确后，将预摇好的种子接入，开始发酵计时，并开始记录各种参数。
5、发酵完毕后清洗罐体和电极，将pH电极插入有3M氯钾的三角瓶中待用，溶氧电极的探头用保护套套好，保存备用。
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